真核有參轉錄組
產品簡介
轉錄組（Transcriptome）是一個生物體內所有基因在特定時期和特定組織或細胞類型中表達出的所有信使RNA（mRNA）的集合，即轉錄組是一個生物體內所有基因的轉錄產物總和。它反映了細胞在某一生理條件下所有基因表達的整體情況，是基因功能及結構研究的基礎和出發點。
技術優勢
1.價格公道合理。
2.樣品處理經驗豐富。
3.分析內容豐富，一站式科研解決平臺。
儀器平臺
Illumina/T7靈活可選
服務流程
分析內容
生信分析條款 | 分析內容 |
標準信息分析 | 1.測序數據過濾 2.參考基因組比對 3.新轉錄本預測 4. SNP和INDEL檢測 5.差異剪接基因檢測 6. 基因表達量計算（基因比對率及表達數目統計、Reads 對轉錄本的覆蓋度及分布、樣品間的相關性、PCA 分析、樣品中基因表達量的分布、樣品間及組間的基因表達情況） 7 差異表達基因檢測 8. 差異表達基因維恩圖分析 9. 差異表達基因層次聚類分析 10. 差異表達基因GO功能分析 11. 差異表達基因Pathway功能分析 12. 差異表達基因轉錄因子預測 13. 差異表達基因蛋白互作分析 |
高級信息分析 | 與客戶協商后，按照實際情況執行 |
送樣建議
樣本類型 | 推薦起始量 | 保存/運輸方式 |
細胞 | >5×106 | 液氮速凍，-80℃保存，干冰運輸 |
動物組織 | >50mg | 液氮速凍，-80℃保存，干冰運輸 |
植物組織 | >100mg | 液氮速凍，-80℃保存，干冰運輸 |
結果展示
案例分析
中科院昆明動物所基于基因組學和感染轉錄組學研究了北平頂猴I型艾滋病病毒（HIV-1）持續性感染的免疫調控機制，為構建合適的HIV-1非人靈長類動物模型提供了科學數據。相關研究論文“Genomic evidence for the nonpathogenic state in HIV-1-infected northern pig-tailed macaques”在線發表在國際知名學術期刊Molecular Biology and Evolution。
缺乏直接感染I型艾滋病病毒（HIV-1）的動物模型是制約艾滋病研究的關鍵瓶頸之一。為構建可直接感染HIV-1并發展為艾滋病的合適非人靈長類動物模型，研究者通過轉錄組學研究了北平頂猴HIV-1持續性感染的免疫調控機制。對HIV-1感染北平頂猴后連續時間點的外周血單核細胞進行了轉錄組測序，篩選與HIV-1復制水平低下相關的候選基因。發現在HIV-1感染北平頂猴后上調的基因中，有一部分干擾素誘導基因（ISG）在感染1-2周迅速上調，其中IFI27基因上調顯著。北平頂猴的IFI27基因與人的同源基因相比發生大量突變。在體外過表達和敲低實驗中，均發現北平頂猴IFI27可能是北平頂猴特異的HIV-1限制因子，可特異地抑制HIV-1復制，這可能也是HIV-1在北平頂猴中低水平復制的機制之一。
